Το 5ο 6θεσιο ολοήμερο Δημοτικό Σχολείο Ερμούπολης πρωτολειτούργησε την δεκαετία του 1960, στην περιοχή Αξός της Ερμούπολης όπου λειτουργεί και σήμερα. Αρχικά, λειτούργησε ως διθέσιο και στεγάστηκε σε ευρύχωρη παλαιά κατοικία της περιοχής με καταβολή ενοικίου, λόγω έλλειψης σχολικής στέγης. Κατά την δεκαετία του 1970 στεγάστηκε σε ιδιόκτητο κτίριο, ικανό να εξυπηρετήσει τις ανάγκες ενός τριθέσιου σχολείου (λόγω αύξησης του μαθητικού πληθυσμού), το οποίο οικοδομήθηκε σε οικόπεδο που παραχωρήθηκε από την «Α.Ε. ΑΙΓΑΙΟ Κλωστοϋφαντήρια». Στο τέλος της ίδιας δεκαετίας και λόγω αναβάθμισής του σε εξαθέσιο σχολείο, οικοδομήθηκε και δεύτερο κτιριακό συγκρότημα στο ίδιο οικόπεδο, προκειμένου να εξυπηρετηθούν οι ανάγκες του Δημοτικού Σχολείου, αλλά και του νεοσύστατου, τότε, 5ου Νηπιαγωγείου Ερμούπολης.
Σήμερα λειτουργεί ως 6/θέσιο Ολοήμερο Δημοτικό Σχολείο με Ενιαίο Αναμορφωμένο Εκπαιδευτικό Πρόγραμμα, στο οποίο φοιτούν 112 μαθητές και διδάσκουν 8 δάσκαλοι και 6 εκπαιδευτικοί άλλων ειδικοτήτων.